Génétique moléculaire et biologie cellulaire

Projet de recherche P5/19 (Action de recherche P5)

Description - Documentation

Personnes :

• Prof. dr.  VAN BROECKHOVEN Christine Universiteit Antwerpen (UA)
  Coordinateur du projet
  Partenaire financé belge
  Durée: 1/1/2002-31/12/2006
  
• Prof. dr.  DE STROOPER Bart Katholieke Universiteit Leuven (K.U.Leuven)
  Partenaire financé belge
  Durée: 1/1/2002-31/12/2006
  
• Prof. dr.  NOTHEN Markus Universiteit Antwerpen (UA)
  Partenaire financé belge
  Durée: 1/1/2002-31/12/2006
  
• Prof. dr.  PANDOLFO Massimo Université Libre de Bruxelles (ULB)
  Partenaire financé belge
  Durée: 1/1/2002-31/12/2006
  
• Prof. dr.  ROBBERECHT Wim Katholieke Universiteit Leuven (K.U.Leuven)
  Partenaire non financé belge
  Durée: 1/1/2002-31/12/2006
  
• Prof. dr.  LEFEBVRE Philippe Université de Liège (ULG)
  Partenaire non financé belge
  Durée: 1/1/2002-31/12/2006
  
• Prof. dr.  PROPPING Peter University of Bonn (BONN)
  Partenaire financé étranger
  Durée: 1/1/2002-31/12/2006
  
• Prof. dr.  SAFTIG Paul Christian-Albrechts-Universität zu Kiel (CAUNIF)
  Partenaire financé étranger
  Durée: 1/1/2002-31/12/2006
  
• Prof. dr.  VAN DUIJN Cornilia Erasmus Universiteit Rotterdam (EUR)
  Partenaire financé étranger
  Durée: 1/1/2002-31/12/2006
  

Description :

Le programme de recherche du réseau est consacré à l’étude des maladies héréditaires humaines du système nerveux central et périphérique, de l’oreille et des os. Toutes ces affections ont une composante majeure liée à l’âge et, en raison du vieillissement de la population, ont un impact majeur sur la qualité de vie des personnes âgées et des conséquences socio-économiques importantes sur nos sociétés occidentales.

En 2001, la séquence préliminaire du génome humain est devenue disponible. La séquence devrait être complète en 2003, 50 ans après la publication de la double hélice de l’ADN par Watson et Crick. Ceci aura une conséquence majeure sur les stratégies utilisées par les généticiens moléculaires et les biologistes cellulaires qui tentent de comprendre les bases moléculaires des maladies humaines. A l’ère post-génomique, il y aura des changements majeur dans leurs approches et objectifs: de la découverte de gènes sur base de la cartographie à la découverte de gènes sur base de la séquence, des maladies monogéniques aux maladies multifactorielles, de l’analyse d’un gène à celle de multiples gènes, de la génomique structurelle à la génomique fonctionnelle, pour ne citer que quelques exemples. Les laboratoires devront s’adapter à ces nouvelles stratégies de façon rapide et efficace ce qui demandera beaucoup de dynamisme de la part des chercheurs. Il sera nécessaire que les équipes académiques individuelles se mettent ensemble pour former de grandes équipes multidisciplinaires et des réseaux qui leur permettront de poursuivre leurs activités avec succès. Des réseaux tels que ceux décrits ici permettront l’accroissement et l’optimisation de la productivité des analyses génétiques génomiques afin de profiter des opportunités données par la publication de la séquence préliminaire du génome humain. Aussi, pour l’expertise complémentaire disponible dans les réseaux, l’analyse fonctionnelle de nouveaux gènes et de gènes déjà connus et des défects génétiques sera efficace et rapide. De plus, les études de biologie cellulaire et les modèles animaux des protéines spécifiques dans des maladies spécifiques identifieront des gènes candidats potentiels et donneront de nouvelles connaissances sur la pathologie des maladies.

Les principaux sujets de recherche du réseau sont la démence d’Alzheimer, les maladies psychiatriques, le retard mental, les déficits auditifs héréditaires, les maladies des os, les neuropathies périphériques et les maladies du neurone moteur, l’épilepsie idiopathique et la physiologie des canaux ioniques. Il s’agit pour la plupart de maladies complexes qui, dans la majorité des cas, sont causés par des facteurs génétiques et environnementaux. De toute façon, il y a des cas rares dans lesquels ce maladies sont héritées comme caractères monogéniques et dans les familles atteintes on a identifié des gènes qui causent ces maladies en utilisant la stratégie du clonage positionnel, qui a permis le clonage du gène respectif à partir de sa position chromosomique identifié à travers des études de ségrégation. Certains de ces gènes provoquant la maladie ont été étudiés et sont toujours à l’étude au niveau de la biologie cellulaire et dans des modèles de souris transgéniques ou invalidés. Les partenaires du réseau ont une expertise dans l’utilisation du clonage positionnel et dans les études d’association pour la cartographie de gènes provoquant les maladies, en technologie génique, en biochimie, en biologie cellulaire, à l’utilisation de lignées de cellules en culture et des cultures cellulaires primaires, en électrophysiologie, en élaboration d’un modèle animal transgénique et invalidé, et dans les études histologiques et morphologiques des tissus humains et de souris.

Le défi majeur du réseau est l’optimisation des stratégies d’identification des gènes à travers l’implantation d’analyses génétiques à haut débit et de bio-informatique pour permettre l’identification rapide de nouveaux gènes ou de nouvelles maladies et pour la susceptibilité à des maladies ; pour optimiser les méthodes complexes de génétique statistique dans l’optique d’identifier les gènes de susceptibilité dans de grandes populations de patients atteints par des formes multifactorielles de maladies; de l’implémentation efficace des approches de biologie cellulaire et des modèles animaux pour des maladies différentes et pour le transfert des connaissances d’histologie et de morphologie entre les différents partenaires.

Documentation :

Références bibliographiques :

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Aph-1, Pen-2, and Nicastrin with Presenilin generate an active gamma-Secretase complex.  DE STROOPER B. Neuron. 38(1), 2003/Apr 

Chloride influx aggravates Ca2+-dependent AMPA receptor-mediated motoneuron death.  VAN DAMME P, CALLEWAERT G, EGGERMONT J, ROBBERECHT W, VAN DEN BOSCH L. J Neurosci. 23(12), 2003b/Jun 

Comparison and meta-analysis of microarray data: from the bench the computer desk.  MOREAU Y, AERTS S, DE MOOR B, DE STROOPER B, DABROWSKI M. Trends Genet. 19(10), 2003/Oct 

De novSCN1A mutations are a major cause of severe myoclonic epilepsy of infancy  CLAES L, CEULEMANS B, AUDENAERT D, SMETS K, LÖFGREN A, DEL-FAVERJ, ALA-MELLS, BASEL-VANAGAITE L, PLECKB, RASKIN S, THIRY P, WOLF NI, VAN BROECKHOVEN C, DE JONGHE P Hum Mutat. 21(6)., 2003/Jun 

Differential modulation of Kv4 kinetics by KCHIP1 splice variants.  Van HOORICK D, RAES A, KEYSERS W, MAYEUR E, SNYDERS DJ. Mol Cell Neurosci. 24(2), 2003/Oct 

Dominant intermediate Charcot-Marie-Tooth type C maps tchromosome 1p34-p35. Am J  JORDANOVA A, THOMAS FP, GUERGUELTCHEVA V, TOURNEV I, GONDIM FA, ISHPEKOVA B, DE VRIENDT E, JACOBS A, LITVINENKI, IVANOVA N, BUZHOV B, DE JONGHE P, KREMENSKY I, TIMMERMAN V. Hum Genet. 73(6), 2003a/Dec 

Efficient removal of LoxP-flanked genes by electroporation of Cre-recombinase mRNA.  VAN DEN PLAS D, PONSAERTS P, VAN TENDELOV, VAN BOCKSTAELE DR, BERNEMAN ZN, MERREGAERT J. Biochem Biophys Res Commun. 305(1), 2003/May 

gamma-Secretase activity requires the presenilin-dependent trafficking of nicastrin through the Golgi apparatus but not its complex glycosylation.  HERREMAN A, Van GASSEN G, BENTAHIR M, NYABI O, CRAESSAERTS K, MUELLER U, ANNAERT W, DE STROOPER B. J Cell Sci. 15;116(Pt 6):, 2003/Mar 

Gene profiling of hippocampal neuronal culture  DABROWSKI M, AERTS S, VAN HUMMELEN P,CRAESSAERTS K, DE MOOR B, ANNAERT W, MOREAU Y, DE STROOPER B. J Neurochem. 85(5), 2003/Jun 

Genetics of early-onset Alzheimer dementia.  RADEMAKERS R, CRUTS M, VAN BROECKHOVEN C. ScientificWorldJournal. 16;3(6), 2003a/Jun 

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Genome scan meta-analysis of schizophrenia and bipolar disorder, part III: Bipolar disorder.  SEGURADR, DETERA-WADLEIGH SD, LEVINSON DF, LEWIS CM , et al… Am J Hum Genet. 73(1), 2003/Jul 

Hereditary cerebral hemorrhage with amyloidosis Dutch type (AbetaPP 693): decreased plasma amyloid-beta 42 concentration.  BORNEBROEK M, DE JONGHE C, HAAN J, KUMAR-SINGH S, YOUNKIN S, ROOS R, VAN BROECKHOVEN C. Neurobiol Dis. 14(3), 2003/Dec 

Identification of novel GDAP1 mutations causing autosomal recessive Charcot-Marie-Tooth disease.  AMMAR N, NELIS E, MERLINI L, BARISIC N, AMOURI R, CEUTERICK C, MARTIN JJ, TIMMERMAN V, HENTATI F, DE JONGHE P. Neuromuscul Disord. 13(9), 2003/Nov 

Isolation and characterization of chondrolectin (Chodl), a novel C-type lectin predominantly expressed in muscle cells.  WENG L, HUBNER R, CLAESSENS A, SMITS P, WAUTERS J, TYLZANOWSKI P, VAN MARCK E, MERREGAERT J. Gene. 10;308, 2003a/Apr 

Macrocephaly and sclerosis of the tubular bones in an isolated patient: a mild case of craniodiaphyseal dysplasia?  JANSSENS K, THOMPSON E, VANHOENACKER F, SAVARIRAYAN R, MORRIS L, DOBBIE A, VAN HUL W. Clin Dysmorphol. 12(4), 2003/Oct 

Mental Retardation : a review of the genetic causes.  WINNEPENNINCKX B, ROOMS L, KOOY RF. Brit J Dev Disabil. 49, 2003 

Mutational spectrum of the WFS1 gene in Wolfram syndrome, nonsyndromic hearing impairment, diabetes mellitus, and psychiatric disease.  CRYNS K, SIVAKUMARAN TA, VAN DEN OUWELAND JM, PENNINGS RJ, CREMERS CW, FLOTHMANN K, YOUNG TL, SMITH RJ, LESPERANCE MM, VAN CAMP G. Hum Mutat. 22(4), 2003/Oct 

Mutations in a Gene Encoding a Novel SH3/TPR Domain Protein Cause Autosomal Recessive Charcot-Marie-Tooth Type 4C Neuropathy.  SENDEREK J, BERGMANN C, STENDEL C, KIRFEL J, VERPOORTEN N, DE JONGHE P, TIMMERMAN V, CHRAST R, H G VERHEIJEN M, LEMKE G, BATTALOGLU E, PARMAN Y, ERDEM S, TAN E, TOPALOGLU H, HAHN A, MULLER-FELBER W, RIZZUTN, FABRIZI GM, STUHRMANN M, et al Am J Hum Genet. 73(6), 2003a/Nov 

Mutations in the neurofilament light chain gene (NEFL) cause early onset severe Charcot-Marie-Tooth disease.  JORDANOVA A, DE JONGHE P, BOERKOEL CF, TAKASHIMA H, DE VRIENDT E, CEUTERICK C, MARTIN JJ, BUTLER IJ, MANCIAS P, PAPASOZOMENOS SCH, TERESPOLSKY D, POTOCKI L, BROWN CW, SHY M, RITA DA, TOURNEV I, KREMENSKY I, LUPSKI JR, TIMMERMAN V. Brain. 126(Pt 3), 2003b/Mar 

Mutations in the small GTP-ase late endosomal protein RAB7 cause Charcot-Marie-Tooth type 2B neuropathy.  VERHOEVEN K, DE JONGHE P, COEN K, VERPOORTEN N, AUER-GRUMBACH M, KWON JM, FITZPATRICK D, SCHMEDDING E, DE VRIENDT E, JACOBS A, VAN GERWEN V, WAGNER K, HARTUNG HP, TIMMERMAN V. Am J Hum Genet. 72(3), 2003b/Mar 

Novel APP mutation V715A associated with presenile Alzheimer's disease in a German family.  CRUTS M, DERMAUT B, RADEMAKERS R, VAN DEN BROECK M, STOGBAUER F, VAN BROECKHOVEN C. J Neurol. 250(11), 2003/Nov 

Of mice and the fragile X syndrome.  KOOY RF. Trends Genet. 19(3), 2003/Mar 

Presenilins mutated at Asp-257 or Asp-385 restore Pen-2 expression and Nicastrin glycosylation but remain catalytically inactive in the absence of wild type Presenilin.  NYABI O, BENTAHIR M, HORRE K, HERREMAN A, GOTTARDI-LITTELL N, VAN BROECKHOVEN C, MERCHIERS P, SPITTAELS K, ANNAERT W, DE STROOPER B. J Biol Chem. 278(44), 2003/Oct 

PRNP Val129 homozygosity increases risk for early-onset Alzheimer's disease.  DERMAUT B, CROES EA, RADEMAKERS R, VAN DEN BROECK M, CRUTS M, HOFMAN A, VAN DUIJN CM, VAN BROECKHOVEN C. Ann Neurol. 53(3), 2003a/Mar 

Prospective Belgian study of neurodegenerative and vascular dementia: APOE genotype effects.  ENGELBORGHS S, DERMAUT B, GOEMAN J, SAERENS J, MARIEN P, PICKUT BA, VAN DEN BROECK M, SERNEELS S, CRUTS M, VAN BROECKHOVEN C, DE DEYN PP. J Neurol Neurosurg Psychiatry. 74(8), 2003/Aug 

Six novel missense mutations in the LDL receptor-related protein 5 (LRP5) gene in different conditions with an increased bone density.  VAN WESENBEECK L, CLEIREN E, GRAM J, BEALS RK, BENICHOU O, SCOPELLITI D, KEY L, RENTON T, BARTELS C, GONG Y, WARMAN ML, DE VERNEJOUL MC, BOLLERSLEV J, VAN HUL W. Am J Hum Genet. 72(3), 2003/Mar 

Slowed conduction and thin myelination of peripheral nerves associated with mutant RhGuanine-nucleotide exchange factor 10.  VERHOEVEN K, DE JONGHE P, VAN DE PUTTE T, NELIS E, ZWIJSEN A, VERPOORTEN N, DE VRIENDT E, JACOBS A, VAN GERWEN V, FRANCIS A, CEUTERICK C, HUYLEBROECK D, TIMMERMAN V. Am J Hum Genet. 73(4), 2003a/Oct 

Syndecan 3 intramembrane proteolysis is presenilin/gamma-secretase-dependent and modulates cytosolic signaling.  SCHULZ JG, ANNAERT W, VANDEKERCKHOVE J, ZIMMERMANN P, DE STROOPER B, DAVID G. J Biol Chem. 278(49), 2003/Dec 

Tau (MAPT) mutation Arg406Trp presenting clinically with Alzheimer disease does not share a common founder in Western Europe.  RADEMAKERS R, DERMAUT B, PEETERS K, CRUTS M, HEUTINK P, GOATE A, VAN BROECKHOVEN C. Hum Mutat. 22(5), 2003b/Nov 

The AMPA receptor antagonist NBQX prolongs survival in a transgenic mouse model of amyotrophic lateral sclerosis.  VAN DAMME P, LEYSSEN M, CALLEWAERT G, ROBBERECHT W, VAN DEN BOSCH L. Neurosci Lett. 343(2), 2003a/Jun 

The cell adhesion protein P-selectin glycoprotein ligand-1 is a substrate for the aspartyl protease BACE1.  LICHTENTHALER SF, DOMINGUEZ DI, WESTMEYER GG, REISS K, HAASS C, SAFTIG P, DE STROOPER B, SEED B. J Biol Chem. 5;278(49), 2003/Dec 

The DTNBP1 (dysbindin) gene contributes tschizophrenia, depending on family history of the disease.  VAN DEN BOGAERT A, SCHUMACHER J, SCHULZE TG, OTTE AC, OHLRAUN S, KOVALENKS, BECKER T, FREUDENBERG J, JONSSON EG, MATTILA-EVENDEN M, SEDVALL GC, CZERSKI PM, KAPELSKI P, HAUSER J, MAIER W, RIETSCHEL M, PROPPING P, NOTHEN MM, CICHON S. Am J Hum Genet. 73(6), 2003/Dec 

Transforming growth factor-beta 1 mutations in Camurati-Engelmann disease lead tincreased signaling by altering either activation or secretion of the mutant protein.  JANSSENS K, TEN DIJKE P, RALSTON SH, BERGMANN C, VAN HUL W. J Biol Chem. 28;278(9), 2003/Feb 

VEGF is a modifier of amyotrophic lateral sclerosis in mice and humans and protects motoneurons against ischemic death.  LAMBRECHTS D, STORKEBAUM E, MORIMOTM, DEL-FAVERJ, DESMET F, MARKLUND SL, WYNS S, THIJS V, ANDERSSON J, VAN MARION I, AL-CHALABI A, BORNES S, MUSSON R, HANSEN V, BECKMAN L, ADOLFSSON R, PALL HS, PRATS H, VERMEIRE S, RUTGEERTS P, et al Nat Genet. 34(4), 2003/Aug