Projet de recherche P4S/251/be-Prepared (Action de recherche P4S)
Pendant la COVID-19 crise, les informations des données cliniques et épidémiologiques, ainsi que les analyses génomiques microbiennes, ont été combinées afin d’informer les décideurs et le public. L’intégration des données provenant de sources diverses est cruciale pour proposer et évaluer des mesures de santé publique. Cependant, aucune architecture robuste n’a été mise en place pour permettre une surveillance intégrée au-delà de la pandémie. Des observations rigoureuses, à la fois en génomique et à l’échelle intersectorielle, sont nécessaires, selon une approche One Health, intégrant la santé humaine, animale et environnementale. La surveillance actuelle des maladies infectieuses en Belgique est organisée de manière sectorielle, et l’échange de données est excessivement lent et fastidieux. Par exemple, une épidémie liée à des produits chocolatés contaminés par la salmonelle et fabriqués en Belgique n'a été détectée que tardivement par nos propres systèmes, alors que d'autres pays l'avaient déjà signalée. Pour prévenir de tels événements à l’avenir, Sciensano a développé une architecture Belgian Preparedness Architecture for Infectious Diseases (be.Prepared) innovante, visant précisément à garantir l’intégration et le couplage des données pathogènes et de santé. Ce cadre national peut soutenir à la fois les investigations de routine sur les maladies infectieuses et les situations de crise, où il sera crucial de renforcer les systèmes de collecte de données et de les relier à un numéro d’identification national unique. Outre les observations, il est nécessaire de partager les données sur la surveillance de routine et les menaces émergentes avec les autorités régionales, communautaires et fédérales, la communauté scientifique et les citoyens. Cela a également été démontré lors de la pandémie de SARS-CoV-2 (2020-2021), lorsque des tableaux de bord ont été rendus accessibles via un site web unique. Plus récemment, pendant l’épidémie de grippe aviaire (2021-2023),
Sciensano a pris l’initiative de mettre en place un tableau de bord pour représenter géographiquement les foyers de grippe aviaire sur le territoire belge. Dans le projet be.Prepared AHEADD , be.Prepared sera utilisé comme méthodologie innovante pour la gestion des épidémies intersectorielles, avec deux applications dans une perspective One Health: (i) Identification des épidémies alimentaires; c’est-à-dire les isolats humains de Salmonella et Listeria provenant d’échantillons alimentaires. (ii) Identification des événements grippaux zoonotiques; c’est-à-dire les cas humains de grippe aviaire, complétés par des données environnementales et des estimations de risque. Concrètement, le Laboratoire de Référence National pour les Pathogènes Alimentaires analysera les échantillons des contrôles effectués par l’AFSCA, créant ainsi une base de données d’indicateurs génomiques pour les pathogènes alimentaires, avec détection automatique de clusters génomiques parmi les isolats humains et alimentaires. Une visualisation publique intersectorielle pour la grippe aviaire, à un niveau génomique et épidémiologique, sera mise en œuvre en collaboration avec plusieurs services de Sciensano et l’Institut Royal Météorologique comme partenaire. Après analyse par des experts, un ensemble de métadonnées pertinentes sur les risques d’introduction et de propagation des pathogènes sera collecté. L’inclusion de ces métadonnées dans une représentation cartographique publique sera évaluée. Tout au long du processus, des indicateurs quantitatifs seront utilisés pour cartographier l’avancement et les résultats des mises en œuvre, par exemple: nombre d’isolats, nombre de liens, nombre d’épidémies évitées, reconstructions phylogéographiques explicites, etc. L’initiative be.Prepared AHEADD, dans le cadre d’une collaboration interdisciplinaire One Health, facilitera la détection rapide des épidémies intersectorielles. Elle soutiendra également l’identification des profils de résistance aux antimicrobiens à partir des données génomiques, la visualisation géographique intuitive de la situation épidémiologique en Belgique, et l’évaluation des risques liés aux événements zoonotiques dans le cadre d’une surveillance génomique et épidémiologique.
