Le CFPS se compose de 33 membres, 16 d'entre eux sont proposés par le Ministre fédéral de la Politique scientifique, 7 sont proposés par le Gouvernement flamand, 4 par le Gouvernement de la Communauté française, 3 sur proposition du Gouvernement de la Région wallonne, 2 par la Région de Bruxelles-Capitale et un membre enfin est proposé par le Gouvernement de la Communauté germanophone.
Les membres du Conseil sont nommés par le Roi et représentent les milieux de la recherche et les milieux socio-économiques.
La composition actuelle du CFPS est la suivante:
| Président | Axel | Legay | UCLouvain |
| Premier vice-président | Herman | Derache | Sirris |
| Vice-présidente | Ann | Dooms | VUB |
| Vice-présidente | Karine | Van Doninck | ULB |
| Membre | Inge | Arents | Flanders Food |
| Membre | Sofie | Bekaert | Koning Boudewijstichting |
| Membre | Vincent | Blondel | UCLouvain |
| Membre | Bertrand | Candelon | UCLouvain |
| Membre | Andreas | De Block | KUL |
| Membre | Caroline | de Cartier | Teach for Belgium |
| Membre | Sarah | De Saeger | UGent |
| Membre | Koenraad | Debackere | KUL |
| Membre | Philippe | Dubois | UMons |
| Membre | Marius | Gilbert | ULB |
| Membre | Verena | Greten | IAWM |
| Membre | Naji | Habra | UNamur |
| Membre | Serge | Habraken | ULiège |
| Membre | Véronique | Halloin | FRS-FNRS |
| Membre | Niel | Hens | UHasselt |
| Membre | Anne | Houtman | Sciences Po Paris |
| Membre | Koen | Janssens | UAntwerpen |
| Membre | Ignace | Lemahieu | UGent |
| Membre | Carine | Michiels | UNamur |
| Membre | Cécile | Neven | UWE |
| Membre | Anne-Sophie | Radermecker | ULB |
| Membre | Sven | Rogge | UGent |
| Membre | Muriel | Ruol | CSC-ACV |
| Membre | Trui | Steen | KUL |
| Membre | Kristiaan | Temst | KUL |
| Membre | Anne | Van den Bosch | Imec |
| Membre | Émilie | Van Haute | ULB |
| Membre | Angélique | Van Ombergen | ESA |
| Membre | Ann | Verlinden | Catalisti (voormalig) |
| Secrétariat | |
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| Président Politique scientifique fédérale | |
| Secrétariat CFPS WTC III Boulevard Simon Bolivar 30 bte 7 1000 Bruxelles  +32 (0)2 238 34 11 CabPvz@belspo.be |
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