| Source DB | nl |
|---|
| Institution | KU Leuven |
|---|
| Code | fbda9170-ad3a-4127-93c5-066e659b5e10 |
|---|
| Unit | bd5a9007-405a-4a9e-90f5-c218b16ae8f2
|
|---|
| Begin | 10/1/2019 |
|---|
| End | 9/30/2023 |
|---|
| title fr |
|
|---|
| title nl | Genomische geneeskunde voor bloedingen, tromboses en bloedplaatjesdefecten
|
|---|
| title en | Genome medicine for bleeding, thrombotic and platelet disorders
|
|---|
| Description fr |
|
|---|
| Description nl | Bloedplaatjes, de tweede meest voorkomende bloedcellen, spelen een essentiële rol in cardiovasculaire ziekten. Aangeboren bloedingen, tromboses en bloedplaatjesdefecten (BTPD) worden gekenmerkt door een uitgeproken genetische heterogeniteit. De lijst van verantwoordelijke genen voor bloedplaatjesvorming en functie, bloedingen en tromboses is blijven groeien tot 100 genen sinds de introductie van high-throughput sequencing (HTS) toepassingen in onderzoek. Dankzij het gebruikt van deze HTS toepassingen werd ook in de diagnostiek vooruitgang geboekt waarbij de opvolging en zelfs de behandeling van BTPD patiënten vooruit ging omdat deze ook vaak andere symptomen hebben naast hun bloedingen of tromboseproblemen. Genetisch onderzoek naar deze 100 genen bij patiënten waarbij men een vermoeden van een BTPD heeft, geeft een diagnose bij ongeveer 50% van de patiënten en bij 40% gaat dit dan om een nog niet eerder beschreven genetische variant terwijl totale genoomanalyse van deze negatieve BTPD patiënten verder kan speuren naar nieuwe kandidaatgenen waarbij nog eens ongeveer 10% van deze patiënten kan rekenen op een diagnose na analyse van de coderende (exonen) regios. Verder onderzoek is noodzakelijk om de ontbrekende BTPD te ontdekken en deze zoektocht zal zich ook moeten zich richten op familiale screening in plaats van enkel aangetaste leden, alternatieve vormen van overeving en het vinden van pathogene varianten buiten de exonen. Het ontrafelen van deze niet coderende regios is een grote uitdaging dat voor bloedcellen mogelijk zal zijn door de BLUEPRINT epigenoom data te gebruiken die voor deze cellen reeds beschikbaar zijn. Deze gegevens zullen aangevuld worden met RNAseq data van bloedplaatjes en megakaryocyten van patiënten met een ontbrekende diagnose. Daarnaast zal er aandacht geschonken worden aan de transitie van het gen-platform naar totale genoomanalyse in een diagnostisch kader. Het uitwisselen van genetische data op international schaal is essentieel en met behulp van experten zal men op deze manier een correcte genetische diagnose kunnen leveren aan nog meer BTPD patiënten omdat nieuwe genen vaak slechts in één enkele familie gevonden worden.
|
|---|
| Description en | Platelets, the 2nd most abundant cell in the blood, play an essential role in cardiovascular disease. Inherited bleeding, thrombotic and platelet disorders (BTPD) are characterized by marked genetic heterogeneity. The list of genes involved in the regulation of platelet formation and function and bleeding or thrombosis has been growing rapidly to almost 100 genes since the introduction of high-throughput sequencing (HTS) approaches in research. Thanks to the gradual adoption of HTS in diagnostic practice, these discoveries are not only improving the diagnostic yield but also the treatment for BTPD patients, who often have symptoms outside the blood system. Screening for all known aetiologies offers a diagnosis for about 50 % of index patients with an expected BTPD and 40% of the discovered variants are novel while whole genome sequencing of these negative BTPD cases allows the identification of a candidate gene in about 10% of these cases by analyzing coding regions. Further research should focus a trio sequencing instead of only index cases, novel modes of inheritance and the identification of variants outside exons. The exploration of the non-coding genome space is a huge challenge that can be tackled with the implementation of our current understanding of the regulatory landscape that is available from BLUEPRINT epigenome data delivered for all blood cell types. These data will be supplemented with RNAseq from platelets and megakaryocytes of unexplained patients. It will be important to work on the transition from targeted sequencing to whole-genome sequencing in a clinical setting. By fostering a culture of data exchange through international collaboration, expert-led teams are expected to deliver a conclusive genetic diagnosis for a larger group of currently unexplained BTPDs as novel candidate genes are still often found in single pedigrees.
|
|---|
| Qualifiers | - RNAsequencing - bleeding - inherited - platelets - thrombosis - whole genomes - |
|---|
| Personal | Van Geet Christel, Labarque Veerle, Freson Kathleen, Ver Donck Fabienne, Peerlinck Kathelijne |
|---|
| Collaborations | |
|---|
